Banca de QUALIFICAÇÃO: MARCUS VINÍCIUS GONÇALVES ANTUNES

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : MARCUS VINÍCIUS GONÇALVES ANTUNES
DATA : 06/12/2023
HORA: 09:00
LOCAL: Videoconferência
TÍTULO:
A bioinformática na investigação das bases moleculares da Síndrome Hereditária do Câncer de Mama e Ovário em Minas Gerais

PALAVRAS-CHAVES:
HBOC, NCCN, Aconselhamento genético, Bioinformática.

PÁGINAS: 153
RESUMO:
O câncer tem se tornado uma das principais causas de morte globais.
Somente no Brasil, para o triênio de 2023 a 2025, o INCA (Instituto Nacional de
Câncer) estima que serão registrados cerca de 704 mil casos. O câncer de mama
feminino é o segundo mais incidente, com 74 mil registros, e é o mais frequente em
todas as regiões do país. Em contraste, o câncer de ovário ocupa a oitava posição,
com uma estimativa de 7,3 mil casos para o mesmo triênio. Dentre os fatores de
risco, os fatores genéticos possuem um papel crucial, com 10 a 15% de casos de
câncer de ovário e 5 a 10% de câncer de mama relacionados a mutações
germinativas, caracterizando a síndrome hereditária de câncer de mama e ovário
(HBOC). Mutações em vários genes podem estar relacionadas a esta síndrome.
Nesse contexto, o uso de tecnologias avançadas, como o sequenciamento de nova
geração (NGS) e painéis multigênicos, tem sido fundamental para a medicina de
precisão no diagnóstico e acompanhamento de pacientes oncológicos. Este estudo
visa otimizar ferramentas de bioinformática para identificação de mutações em
pacientes do Centro-Oeste de Minas Gerais atendidos pelo SUS que preencheram
critérios clínicos para HBOC. Regiões de exons, porções 3' e 5' UTR, e sítios de
splicing de 22 genes de 72 probandos foram sequenciadas, seguindo as diretrizes
do National Comprehensive Cancer Network (NCCN). As análises em bioinformática
foram conduzidas por dois pipelines distintos: o aplicativo DNA Amplicom, da
empresa Illumina, e o pipeline independente, desenvolvido pelo Laboratório de
Diversidade Genética Humana (LDGH) da UFMG e adaptado. Os arquivos FASTQ
gerados no sequenciamento apresentaram alta qualidade, com mais de 19 milhões
de reads, das quais 96% apresentaram phred score superior a Q30. As métricas de
alinhamento dos arquivos BAM dos dois pipelines foram semelhantes, com
cobertura variando de 66 a 363X vertical e 63 a 99,9% horizontal. As amostras com
baixa cobertura foram resequenciadas. Foram identificadas aproximadamente 8,3
mil variantes pelo pipeline independente e 8,5 mil pelo DNA Amplicon, armazenadas
em arquivos VCF. Apesar de não terem sido observadas diferenças estatísticas
significativas nas análises gerais entre os pipelines, a planilha gerada pelo DNA
Amplicon apresentou menos artefatos e mais variantes que atenderam às métricas
desejadas para os relatórios clínicos finais (DP > 20X e cerca de 50% de frequênciaviii
alélica). Ao final, mutações patogênicas foram identificadas em 19,44% dos
probandos (14/72) e mutações provavelmente patogênicas em 2,78% (2/72),
principalmente nos genes BRCA1/2. Além disso, VUS foram encontradas em
13,89% dos probandos (10/72), com maior frequência no gene ATM. Os relatórios
clínicos foram liberados seguindo critérios mínimos de cobertura vertical (≥ 100X) e
horizontal (global: 20X ≥ 90%; gene: 1X ≥ 90%). Projetos como este fortalecem a
conexão entre a universidade e a sociedade, proporcionando um retorno direto à
comunidade com dados e informações importantes coletadas durante a pesquisa
científica.

MEMBROS DA BANCA:
Externa à Instituição - JULIA MARIA SARAIVA DUARTE - UFMG
Externo ao Programa - 3295713 - ISRAEL JOSE PEREIRA GARCIA
Presidente - 1457505 - LUCIANA LARA DOS SANTOS
Notícia cadastrada em: 23/11/2023 13:32
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